Fortalecer la productividad, consumo del café y desarrollo de mercados de la cafeticultura nacional, impulsando para ello la investigación, el desarrollo de tecnologías de vanguardia para innovar los procesos de producción primaria, post cosecha y la agroindustria del café.

Contribuir en la toma de decisiones para la formulación, aplicación y evaluación de políticas públicas que promuevan el desarrollo sustentable de las regiones cafetaleras del país.

Impulsar el mejoramiento de los aspectos socioeconómicos del sector cafetalero y el fomento de alianzas interinstitucionales con las instituciones de enseñanza e investigación para la planeación, desarrollo, ejecución y difusión de proyectos de investigación y desarrollo cafetalero.

Desarrollar investigación científica y tecnológica ligada a la docencia que permita la transferencia oportuna al sector rural de las innovaciones científicas y tecnológicas, con el fin de elevar la calidad de vida en los aspectos económico y cultural.

Incrementar la competitividad, basada en estándares de alta calidad perfeccionando los sistemas de comercialización; fomentando el hábito de consumo de cafés de calidad entre la población e incrementando el comercio de cafés sustentables, diferenciados y de especialidad de acuerdo a las normas internacionales.

Generar conocimientos que aporten soluciones a los múltiples problemas y demandas del sector cafetalero nacional.

Implementar la estrategia de vinculación y transferencia de tecnología, mediante procesos de capacitación a técnicos, productores y la asistencia técnica, con el establecimiento y operación de campos regionales de investigación e innovación del CENACAFE.